Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms