Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Klc3Q91W40 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Klc3Q91W40 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Klc3Q91W40 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Klc3Q91W40 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Klc3Q91W40 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Klc3Q91W40 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Klc3Q91W40 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Klc3Q91W40 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Klc3Q91W40 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Klc3Q91W40 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Klc3Q91W40 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Klc3Q91W40 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Klc3Q91W40 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Klc3Q91W40 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Klc3Q91W40 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Klc3Q91W40 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Klc3Q91W40 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Klc3Q91W40 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Klc3Q91W40 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Klc3Q91W40 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Klc3Q91W40 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Klc3Q91W40 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Klc3Q91W40 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Klc3Q91W40 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Klc3Q91W40 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Klc3Q91W40 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Klc3Q91W40 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Klc3Q91W40 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Klc3Q91W40 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Klc3Q91W40 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Klc3Q91W40 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Klc3Q91W40 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Klc3Q91W40 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Klc3Q91W40 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Klc3Q91W40 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Klc3Q91W40 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Klc3Q91W40 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Klc3Q91W40 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Klc3Q91W40 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Klc3Q91W40 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Klc3Q91W40 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Klc3Q91W40 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Klc3Q91W40 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Klc3Q91W40 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Klc3Q91W40 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Klc3Q91W40 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Klc3Q91W40 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Klc3Q91W40 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Klc3Q91W40 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Klc3Q91W40 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Klc3Q91W40 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Klc3Q91W40 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Klc3Q91W40 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Klc3Q91W40 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Klc3Q91W40 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Klc3Q91W40 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Klc3Q91W40 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Klc3Q91W40 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Klc3Q91W40 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Klc3Q91W40 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Klc3Q91W40 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Klc3Q91W40 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Klc3Q91W40 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Klc3Q91W40 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Klc3Q91W40 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Klc3Q91W40 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Klc3Q91W40 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Klc3Q91W40 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Klc3Q91W40 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Klc3Q91W40 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Klc3Q91W40 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Klc3Q91W40 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Klc3Q91W40 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Klc3Q91W40 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Klc3Q91W40 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Klc3Q91W40 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Klc3Q91W40 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Klc3Q91W40 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Klc3Q91W40 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Klc3Q91W40 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Klc3Q91W40 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Klc3Q91W40 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Klc3Q91W40 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Klc3Q91W40 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Klc3Q91W40 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Klc3Q91W40 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Klc3Q91W40 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Klc3Q91W40 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Klc3Q91W40 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Klc3Q91W40 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Klc3Q91W40 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Klc3Q91W40 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Klc3Q91W40 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Klc3Q91W40 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Klc3Q91W40 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Klc3Q91W40 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Klc3Q91W40 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Klc3Q91W40 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Klc3Q91W40 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms