Protein–RNA interactions for Protein: Q91VA3

Capn8, Calpain-8, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn8Q91VA3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Capn8Q91VA3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Capn8Q91VA3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Capn8Q91VA3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Capn8Q91VA3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Capn8Q91VA3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Capn8Q91VA3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Capn8Q91VA3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Capn8Q91VA3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Capn8Q91VA3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Capn8Q91VA3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Capn8Q91VA3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Capn8Q91VA3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Capn8Q91VA3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Capn8Q91VA3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Capn8Q91VA3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Capn8Q91VA3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Capn8Q91VA3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capn8Q91VA3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capn8Q91VA3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capn8Q91VA3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capn8Q91VA3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capn8Q91VA3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capn8Q91VA3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Capn8Q91VA3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capn8Q91VA3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capn8Q91VA3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capn8Q91VA3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capn8Q91VA3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capn8Q91VA3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capn8Q91VA3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capn8Q91VA3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capn8Q91VA3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capn8Q91VA3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capn8Q91VA3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capn8Q91VA3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn8Q91VA3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn8Q91VA3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn8Q91VA3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn8Q91VA3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn8Q91VA3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn8Q91VA3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn8Q91VA3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn8Q91VA3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn8Q91VA3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn8Q91VA3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn8Q91VA3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn8Q91VA3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn8Q91VA3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn8Q91VA3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn8Q91VA3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn8Q91VA3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn8Q91VA3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn8Q91VA3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn8Q91VA3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn8Q91VA3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn8Q91VA3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn8Q91VA3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn8Q91VA3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Capn8Q91VA3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Capn8Q91VA3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Capn8Q91VA3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Capn8Q91VA3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Capn8Q91VA3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Capn8Q91VA3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Capn8Q91VA3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Capn8Q91VA3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Capn8Q91VA3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Capn8Q91VA3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Capn8Q91VA3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Capn8Q91VA3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Capn8Q91VA3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Capn8Q91VA3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Capn8Q91VA3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Capn8Q91VA3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Capn8Q91VA3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Capn8Q91VA3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms