Protein–RNA interactions for Protein: Q8VI88

Odf4, Outer dense fiber protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf4Q8VI88 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Odf4Q8VI88 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Odf4Q8VI88 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Odf4Q8VI88 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Odf4Q8VI88 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Odf4Q8VI88 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Odf4Q8VI88 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Odf4Q8VI88 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Odf4Q8VI88 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Odf4Q8VI88 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Odf4Q8VI88 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Odf4Q8VI88 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Odf4Q8VI88 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Odf4Q8VI88 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Odf4Q8VI88 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Odf4Q8VI88 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Odf4Q8VI88 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Odf4Q8VI88 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Odf4Q8VI88 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Odf4Q8VI88 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Odf4Q8VI88 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Odf4Q8VI88 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Odf4Q8VI88 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Odf4Q8VI88 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Odf4Q8VI88 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Odf4Q8VI88 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Odf4Q8VI88 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Odf4Q8VI88 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Odf4Q8VI88 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Odf4Q8VI88 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Odf4Q8VI88 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Odf4Q8VI88 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Odf4Q8VI88 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Odf4Q8VI88 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Odf4Q8VI88 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Odf4Q8VI88 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Odf4Q8VI88 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Odf4Q8VI88 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Odf4Q8VI88 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Odf4Q8VI88 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Odf4Q8VI88 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Odf4Q8VI88 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Odf4Q8VI88 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Odf4Q8VI88 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Odf4Q8VI88 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Odf4Q8VI88 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Odf4Q8VI88 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Odf4Q8VI88 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Odf4Q8VI88 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Odf4Q8VI88 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms