Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC3

Selenom, Selenoprotein M, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenomQ8VHC3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SelenomQ8VHC3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SelenomQ8VHC3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SelenomQ8VHC3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SelenomQ8VHC3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SelenomQ8VHC3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SelenomQ8VHC3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SelenomQ8VHC3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SelenomQ8VHC3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SelenomQ8VHC3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SelenomQ8VHC3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SelenomQ8VHC3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SelenomQ8VHC3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SelenomQ8VHC3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SelenomQ8VHC3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SelenomQ8VHC3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SelenomQ8VHC3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SelenomQ8VHC3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SelenomQ8VHC3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SelenomQ8VHC3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SelenomQ8VHC3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SelenomQ8VHC3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SelenomQ8VHC3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SelenomQ8VHC3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SelenomQ8VHC3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SelenomQ8VHC3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SelenomQ8VHC3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SelenomQ8VHC3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SelenomQ8VHC3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SelenomQ8VHC3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SelenomQ8VHC3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SelenomQ8VHC3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SelenomQ8VHC3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SelenomQ8VHC3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SelenomQ8VHC3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SelenomQ8VHC3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SelenomQ8VHC3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SelenomQ8VHC3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SelenomQ8VHC3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SelenomQ8VHC3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SelenomQ8VHC3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SelenomQ8VHC3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SelenomQ8VHC3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SelenomQ8VHC3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SelenomQ8VHC3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SelenomQ8VHC3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SelenomQ8VHC3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SelenomQ8VHC3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SelenomQ8VHC3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms