Protein–RNA interactions for Protein: Q8VGL0

Olfr340, Olfactory receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Olfr340Q8VGL0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Olfr340Q8VGL0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Olfr340Q8VGL0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Olfr340Q8VGL0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Olfr340Q8VGL0 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Olfr340Q8VGL0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Olfr340Q8VGL0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Olfr340Q8VGL0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Olfr340Q8VGL0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Olfr340Q8VGL0 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Olfr340Q8VGL0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Olfr340Q8VGL0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Olfr340Q8VGL0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Olfr340Q8VGL0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Olfr340Q8VGL0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Olfr340Q8VGL0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Olfr340Q8VGL0 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Olfr340Q8VGL0 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Olfr340Q8VGL0 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Olfr340Q8VGL0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Olfr340Q8VGL0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Olfr340Q8VGL0 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms