Protein–RNA interactions for Protein: Q8R422

Cd109, CD109 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd109Q8R422 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cd109Q8R422 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cd109Q8R422 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cd109Q8R422 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cd109Q8R422 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cd109Q8R422 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cd109Q8R422 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cd109Q8R422 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cd109Q8R422 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cd109Q8R422 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cd109Q8R422 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cd109Q8R422 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cd109Q8R422 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cd109Q8R422 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cd109Q8R422 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cd109Q8R422 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cd109Q8R422 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cd109Q8R422 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cd109Q8R422 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cd109Q8R422 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cd109Q8R422 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cd109Q8R422 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Cd109Q8R422 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cd109Q8R422 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cd109Q8R422 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cd109Q8R422 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cd109Q8R422 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cd109Q8R422 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cd109Q8R422 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cd109Q8R422 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Cd109Q8R422 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cd109Q8R422 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cd109Q8R422 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cd109Q8R422 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cd109Q8R422 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cd109Q8R422 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cd109Q8R422 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cd109Q8R422 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Cd109Q8R422 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cd109Q8R422 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cd109Q8R422 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cd109Q8R422 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cd109Q8R422 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cd109Q8R422 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cd109Q8R422 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cd109Q8R422 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cd109Q8R422 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cd109Q8R422 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cd109Q8R422 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cd109Q8R422 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cd109Q8R422 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Cd109Q8R422 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cd109Q8R422 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cd109Q8R422 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cd109Q8R422 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cd109Q8R422 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cd109Q8R422 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cd109Q8R422 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cd109Q8R422 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cd109Q8R422 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cd109Q8R422 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cd109Q8R422 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Cd109Q8R422 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cd109Q8R422 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cd109Q8R422 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cd109Q8R422 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cd109Q8R422 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cd109Q8R422 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cd109Q8R422 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Cd109Q8R422 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Cd109Q8R422 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cd109Q8R422 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cd109Q8R422 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cd109Q8R422 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cd109Q8R422 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cd109Q8R422 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cd109Q8R422 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cd109Q8R422 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cd109Q8R422 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cd109Q8R422 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cd109Q8R422 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cd109Q8R422 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cd109Q8R422 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cd109Q8R422 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cd109Q8R422 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cd109Q8R422 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Cd109Q8R422 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cd109Q8R422 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cd109Q8R422 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cd109Q8R422 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cd109Q8R422 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cd109Q8R422 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cd109Q8R422 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cd109Q8R422 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cd109Q8R422 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cd109Q8R422 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cd109Q8R422 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cd109Q8R422 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cd109Q8R422 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cd109Q8R422 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms