Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms