Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms