Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3J4

Mterf3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf3Q8R3J4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mterf3Q8R3J4 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mterf3Q8R3J4 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mterf3Q8R3J4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mterf3Q8R3J4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mterf3Q8R3J4 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mterf3Q8R3J4 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mterf3Q8R3J4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mterf3Q8R3J4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mterf3Q8R3J4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mterf3Q8R3J4 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mterf3Q8R3J4 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mterf3Q8R3J4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mterf3Q8R3J4 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mterf3Q8R3J4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mterf3Q8R3J4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mterf3Q8R3J4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mterf3Q8R3J4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mterf3Q8R3J4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mterf3Q8R3J4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mterf3Q8R3J4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mterf3Q8R3J4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mterf3Q8R3J4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mterf3Q8R3J4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mterf3Q8R3J4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mterf3Q8R3J4 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Mterf3Q8R3J4 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mterf3Q8R3J4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms