Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Hecw1Q8K4P8 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Hecw1Q8K4P8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Hecw1Q8K4P8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Hecw1Q8K4P8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Hecw1Q8K4P8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hecw1Q8K4P8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Hecw1Q8K4P8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hecw1Q8K4P8 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hecw1Q8K4P8 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hecw1Q8K4P8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hecw1Q8K4P8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hecw1Q8K4P8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hecw1Q8K4P8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hecw1Q8K4P8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hecw1Q8K4P8 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hecw1Q8K4P8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hecw1Q8K4P8 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hecw1Q8K4P8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hecw1Q8K4P8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hecw1Q8K4P8 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hecw1Q8K4P8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hecw1Q8K4P8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hecw1Q8K4P8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hecw1Q8K4P8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hecw1Q8K4P8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hecw1Q8K4P8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hecw1Q8K4P8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hecw1Q8K4P8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hecw1Q8K4P8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hecw1Q8K4P8 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hecw1Q8K4P8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hecw1Q8K4P8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Hecw1Q8K4P8 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hecw1Q8K4P8 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hecw1Q8K4P8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Hecw1Q8K4P8 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Hecw1Q8K4P8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hecw1Q8K4P8 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hecw1Q8K4P8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hecw1Q8K4P8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hecw1Q8K4P8 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hecw1Q8K4P8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hecw1Q8K4P8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hecw1Q8K4P8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hecw1Q8K4P8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hecw1Q8K4P8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hecw1Q8K4P8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hecw1Q8K4P8 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hecw1Q8K4P8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hecw1Q8K4P8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hecw1Q8K4P8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hecw1Q8K4P8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hecw1Q8K4P8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hecw1Q8K4P8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hecw1Q8K4P8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hecw1Q8K4P8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hecw1Q8K4P8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hecw1Q8K4P8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hecw1Q8K4P8 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hecw1Q8K4P8 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hecw1Q8K4P8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hecw1Q8K4P8 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hecw1Q8K4P8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Hecw1Q8K4P8 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hecw1Q8K4P8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hecw1Q8K4P8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hecw1Q8K4P8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hecw1Q8K4P8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hecw1Q8K4P8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hecw1Q8K4P8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hecw1Q8K4P8 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hecw1Q8K4P8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hecw1Q8K4P8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hecw1Q8K4P8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Hecw1Q8K4P8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Hecw1Q8K4P8 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hecw1Q8K4P8 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hecw1Q8K4P8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hecw1Q8K4P8 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Hecw1Q8K4P8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hecw1Q8K4P8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hecw1Q8K4P8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hecw1Q8K4P8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hecw1Q8K4P8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hecw1Q8K4P8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hecw1Q8K4P8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hecw1Q8K4P8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hecw1Q8K4P8 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hecw1Q8K4P8 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hecw1Q8K4P8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hecw1Q8K4P8 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hecw1Q8K4P8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hecw1Q8K4P8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hecw1Q8K4P8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hecw1Q8K4P8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hecw1Q8K4P8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hecw1Q8K4P8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hecw1Q8K4P8 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hecw1Q8K4P8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms