Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4J2

Ebf4, Transcription factor COE4, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf4Q8K4J2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ebf4Q8K4J2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms