Protein–RNA interactions for Protein: Q8K389

Cdk5rap2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap2Q8K389 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdk5rap2Q8K389 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdk5rap2Q8K389 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdk5rap2Q8K389 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdk5rap2Q8K389 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdk5rap2Q8K389 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdk5rap2Q8K389 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdk5rap2Q8K389 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdk5rap2Q8K389 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdk5rap2Q8K389 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdk5rap2Q8K389 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cdk5rap2Q8K389 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdk5rap2Q8K389 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdk5rap2Q8K389 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdk5rap2Q8K389 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdk5rap2Q8K389 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdk5rap2Q8K389 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdk5rap2Q8K389 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdk5rap2Q8K389 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdk5rap2Q8K389 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdk5rap2Q8K389 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdk5rap2Q8K389 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdk5rap2Q8K389 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdk5rap2Q8K389 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdk5rap2Q8K389 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdk5rap2Q8K389 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdk5rap2Q8K389 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdk5rap2Q8K389 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdk5rap2Q8K389 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdk5rap2Q8K389 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdk5rap2Q8K389 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdk5rap2Q8K389 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdk5rap2Q8K389 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdk5rap2Q8K389 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdk5rap2Q8K389 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdk5rap2Q8K389 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdk5rap2Q8K389 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdk5rap2Q8K389 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdk5rap2Q8K389 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdk5rap2Q8K389 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdk5rap2Q8K389 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdk5rap2Q8K389 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdk5rap2Q8K389 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdk5rap2Q8K389 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdk5rap2Q8K389 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdk5rap2Q8K389 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdk5rap2Q8K389 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdk5rap2Q8K389 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdk5rap2Q8K389 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdk5rap2Q8K389 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdk5rap2Q8K389 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdk5rap2Q8K389 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdk5rap2Q8K389 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdk5rap2Q8K389 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdk5rap2Q8K389 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdk5rap2Q8K389 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdk5rap2Q8K389 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdk5rap2Q8K389 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdk5rap2Q8K389 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdk5rap2Q8K389 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdk5rap2Q8K389 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdk5rap2Q8K389 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdk5rap2Q8K389 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdk5rap2Q8K389 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdk5rap2Q8K389 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdk5rap2Q8K389 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdk5rap2Q8K389 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdk5rap2Q8K389 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdk5rap2Q8K389 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdk5rap2Q8K389 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdk5rap2Q8K389 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdk5rap2Q8K389 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdk5rap2Q8K389 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdk5rap2Q8K389 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdk5rap2Q8K389 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdk5rap2Q8K389 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdk5rap2Q8K389 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdk5rap2Q8K389 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdk5rap2Q8K389 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdk5rap2Q8K389 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdk5rap2Q8K389 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdk5rap2Q8K389 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdk5rap2Q8K389 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdk5rap2Q8K389 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdk5rap2Q8K389 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdk5rap2Q8K389 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdk5rap2Q8K389 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdk5rap2Q8K389 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdk5rap2Q8K389 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cdk5rap2Q8K389 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cdk5rap2Q8K389 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cdk5rap2Q8K389 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cdk5rap2Q8K389 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cdk5rap2Q8K389 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cdk5rap2Q8K389 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cdk5rap2Q8K389 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cdk5rap2Q8K389 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cdk5rap2Q8K389 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cdk5rap2Q8K389 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdk5rap2Q8K389 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms