Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ssh3Q8K330 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms