Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc12Q8K2L8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc12Q8K2L8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc12Q8K2L8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc12Q8K2L8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc12Q8K2L8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc12Q8K2L8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc12Q8K2L8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc12Q8K2L8 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc12Q8K2L8 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc12Q8K2L8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc12Q8K2L8 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc12Q8K2L8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc12Q8K2L8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc12Q8K2L8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc12Q8K2L8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc12Q8K2L8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc12Q8K2L8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc12Q8K2L8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc12Q8K2L8 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc12Q8K2L8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc12Q8K2L8 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc12Q8K2L8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc12Q8K2L8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc12Q8K2L8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc12Q8K2L8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc12Q8K2L8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc12Q8K2L8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc12Q8K2L8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc12Q8K2L8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc12Q8K2L8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc12Q8K2L8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc12Q8K2L8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc12Q8K2L8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc12Q8K2L8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc12Q8K2L8 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc12Q8K2L8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc12Q8K2L8 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc12Q8K2L8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc12Q8K2L8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc12Q8K2L8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc12Q8K2L8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc12Q8K2L8 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc12Q8K2L8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc12Q8K2L8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc12Q8K2L8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc12Q8K2L8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc12Q8K2L8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc12Q8K2L8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc12Q8K2L8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc12Q8K2L8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc12Q8K2L8 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc12Q8K2L8 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc12Q8K2L8 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc12Q8K2L8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc12Q8K2L8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc12Q8K2L8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc12Q8K2L8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc12Q8K2L8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc12Q8K2L8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc12Q8K2L8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc12Q8K2L8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc12Q8K2L8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trappc12Q8K2L8 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trappc12Q8K2L8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trappc12Q8K2L8 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
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Trappc12Q8K2L8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trappc12Q8K2L8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trappc12Q8K2L8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trappc12Q8K2L8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trappc12Q8K2L8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc12Q8K2L8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc12Q8K2L8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc12Q8K2L8 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc12Q8K2L8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc12Q8K2L8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc12Q8K2L8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc12Q8K2L8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc12Q8K2L8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc12Q8K2L8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc12Q8K2L8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc12Q8K2L8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc12Q8K2L8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc12Q8K2L8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc12Q8K2L8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc12Q8K2L8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc12Q8K2L8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc12Q8K2L8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc12Q8K2L8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc12Q8K2L8 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc12Q8K2L8 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc12Q8K2L8 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc12Q8K2L8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc12Q8K2L8 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc12Q8K2L8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc12Q8K2L8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc12Q8K2L8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc12Q8K2L8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc12Q8K2L8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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