Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2H2

Otud6b, OTU domain-containing protein 6B, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6bQ8K2H2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Otud6bQ8K2H2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms