Protein–RNA interactions for Protein: Q8K296

Mtmr3, Myotubularin-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr3Q8K296 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mtmr3Q8K296 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Mtmr3Q8K296 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mtmr3Q8K296 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mtmr3Q8K296 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mtmr3Q8K296 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mtmr3Q8K296 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mtmr3Q8K296 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mtmr3Q8K296 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mtmr3Q8K296 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mtmr3Q8K296 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mtmr3Q8K296 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mtmr3Q8K296 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mtmr3Q8K296 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mtmr3Q8K296 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mtmr3Q8K296 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mtmr3Q8K296 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mtmr3Q8K296 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mtmr3Q8K296 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mtmr3Q8K296 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mtmr3Q8K296 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mtmr3Q8K296 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mtmr3Q8K296 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Mtmr3Q8K296 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Mtmr3Q8K296 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mtmr3Q8K296 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mtmr3Q8K296 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mtmr3Q8K296 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mtmr3Q8K296 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mtmr3Q8K296 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mtmr3Q8K296 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mtmr3Q8K296 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mtmr3Q8K296 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mtmr3Q8K296 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mtmr3Q8K296 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mtmr3Q8K296 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mtmr3Q8K296 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mtmr3Q8K296 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mtmr3Q8K296 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mtmr3Q8K296 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mtmr3Q8K296 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mtmr3Q8K296 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mtmr3Q8K296 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mtmr3Q8K296 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Mtmr3Q8K296 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mtmr3Q8K296 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mtmr3Q8K296 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mtmr3Q8K296 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mtmr3Q8K296 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mtmr3Q8K296 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mtmr3Q8K296 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mtmr3Q8K296 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mtmr3Q8K296 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mtmr3Q8K296 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Mtmr3Q8K296 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mtmr3Q8K296 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Mtmr3Q8K296 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mtmr3Q8K296 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mtmr3Q8K296 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mtmr3Q8K296 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mtmr3Q8K296 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mtmr3Q8K296 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mtmr3Q8K296 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mtmr3Q8K296 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mtmr3Q8K296 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Mtmr3Q8K296 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mtmr3Q8K296 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mtmr3Q8K296 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mtmr3Q8K296 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mtmr3Q8K296 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Mtmr3Q8K296 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mtmr3Q8K296 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mtmr3Q8K296 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mtmr3Q8K296 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mtmr3Q8K296 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mtmr3Q8K296 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mtmr3Q8K296 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mtmr3Q8K296 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Mtmr3Q8K296 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mtmr3Q8K296 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mtmr3Q8K296 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mtmr3Q8K296 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mtmr3Q8K296 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mtmr3Q8K296 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mtmr3Q8K296 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mtmr3Q8K296 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mtmr3Q8K296 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mtmr3Q8K296 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mtmr3Q8K296 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mtmr3Q8K296 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mtmr3Q8K296 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mtmr3Q8K296 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mtmr3Q8K296 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mtmr3Q8K296 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mtmr3Q8K296 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mtmr3Q8K296 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mtmr3Q8K296 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mtmr3Q8K296 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mtmr3Q8K296 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mtmr3Q8K296 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms