Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
FgbQ8K0E8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FgbQ8K0E8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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