Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW5

Sh2d5, SH2 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d5Q8JZW5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh2d5Q8JZW5 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sh2d5Q8JZW5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sh2d5Q8JZW5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sh2d5Q8JZW5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sh2d5Q8JZW5 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh2d5Q8JZW5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh2d5Q8JZW5 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh2d5Q8JZW5 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh2d5Q8JZW5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh2d5Q8JZW5 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh2d5Q8JZW5 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh2d5Q8JZW5 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh2d5Q8JZW5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh2d5Q8JZW5 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh2d5Q8JZW5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh2d5Q8JZW5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh2d5Q8JZW5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh2d5Q8JZW5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh2d5Q8JZW5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh2d5Q8JZW5 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Sh2d5Q8JZW5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh2d5Q8JZW5 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh2d5Q8JZW5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh2d5Q8JZW5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh2d5Q8JZW5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh2d5Q8JZW5 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh2d5Q8JZW5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sh2d5Q8JZW5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh2d5Q8JZW5 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh2d5Q8JZW5 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Sh2d5Q8JZW5 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sh2d5Q8JZW5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh2d5Q8JZW5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh2d5Q8JZW5 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh2d5Q8JZW5 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh2d5Q8JZW5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh2d5Q8JZW5 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh2d5Q8JZW5 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh2d5Q8JZW5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh2d5Q8JZW5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh2d5Q8JZW5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh2d5Q8JZW5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh2d5Q8JZW5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh2d5Q8JZW5 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh2d5Q8JZW5 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh2d5Q8JZW5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh2d5Q8JZW5 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh2d5Q8JZW5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh2d5Q8JZW5 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh2d5Q8JZW5 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh2d5Q8JZW5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh2d5Q8JZW5 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh2d5Q8JZW5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh2d5Q8JZW5 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh2d5Q8JZW5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh2d5Q8JZW5 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh2d5Q8JZW5 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh2d5Q8JZW5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh2d5Q8JZW5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh2d5Q8JZW5 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh2d5Q8JZW5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh2d5Q8JZW5 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh2d5Q8JZW5 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh2d5Q8JZW5 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh2d5Q8JZW5 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh2d5Q8JZW5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh2d5Q8JZW5 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms