Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rasgef1bQ8JZL7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms