Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

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Length 1,038 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf628Q8CJ78 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf628Q8CJ78 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf628Q8CJ78 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf628Q8CJ78 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf628Q8CJ78 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf628Q8CJ78 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf628Q8CJ78 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf628Q8CJ78 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf628Q8CJ78 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf628Q8CJ78 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf628Q8CJ78 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf628Q8CJ78 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf628Q8CJ78 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf628Q8CJ78 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf628Q8CJ78 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf628Q8CJ78 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf628Q8CJ78 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf628Q8CJ78 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf628Q8CJ78 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf628Q8CJ78 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf628Q8CJ78 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf628Q8CJ78 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf628Q8CJ78 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf628Q8CJ78 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf628Q8CJ78 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf628Q8CJ78 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf628Q8CJ78 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf628Q8CJ78 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf628Q8CJ78 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf628Q8CJ78 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf628Q8CJ78 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf628Q8CJ78 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf628Q8CJ78 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf628Q8CJ78 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf628Q8CJ78 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf628Q8CJ78 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf628Q8CJ78 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf628Q8CJ78 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf628Q8CJ78 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf628Q8CJ78 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf628Q8CJ78 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf628Q8CJ78 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf628Q8CJ78 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf628Q8CJ78 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf628Q8CJ78 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf628Q8CJ78 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf628Q8CJ78 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf628Q8CJ78 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf628Q8CJ78 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf628Q8CJ78 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf628Q8CJ78 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf628Q8CJ78 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf628Q8CJ78 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf628Q8CJ78 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf628Q8CJ78 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf628Q8CJ78 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf628Q8CJ78 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf628Q8CJ78 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf628Q8CJ78 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf628Q8CJ78 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf628Q8CJ78 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf628Q8CJ78 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf628Q8CJ78 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf628Q8CJ78 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf628Q8CJ78 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf628Q8CJ78 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf628Q8CJ78 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf628Q8CJ78 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf628Q8CJ78 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf628Q8CJ78 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf628Q8CJ78 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf628Q8CJ78 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf628Q8CJ78 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf628Q8CJ78 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf628Q8CJ78 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf628Q8CJ78 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf628Q8CJ78 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf628Q8CJ78 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf628Q8CJ78 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf628Q8CJ78 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf628Q8CJ78 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Znf628Q8CJ78 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Znf628Q8CJ78 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Znf628Q8CJ78 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Znf628Q8CJ78 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms