Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trip10Q8CJ53 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms