Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CopaQ8CIE6 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms