Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHI8

Ep400, E1A-binding protein p400, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,072 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ep400Q8CHI8 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ep400Q8CHI8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ep400Q8CHI8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ep400Q8CHI8 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ep400Q8CHI8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ep400Q8CHI8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ep400Q8CHI8 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ep400Q8CHI8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ep400Q8CHI8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ep400Q8CHI8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ep400Q8CHI8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ep400Q8CHI8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ep400Q8CHI8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ep400Q8CHI8 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ep400Q8CHI8 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ep400Q8CHI8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ep400Q8CHI8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ep400Q8CHI8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ep400Q8CHI8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ep400Q8CHI8 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ep400Q8CHI8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ep400Q8CHI8 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ep400Q8CHI8 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ep400Q8CHI8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79 ms