Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGV2

Tph2, Tryptophan 5-hydroxylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tph2Q8CGV2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tph2Q8CGV2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tph2Q8CGV2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tph2Q8CGV2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tph2Q8CGV2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tph2Q8CGV2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tph2Q8CGV2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tph2Q8CGV2 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tph2Q8CGV2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tph2Q8CGV2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tph2Q8CGV2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tph2Q8CGV2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tph2Q8CGV2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tph2Q8CGV2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tph2Q8CGV2 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tph2Q8CGV2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tph2Q8CGV2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tph2Q8CGV2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tph2Q8CGV2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tph2Q8CGV2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tph2Q8CGV2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tph2Q8CGV2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tph2Q8CGV2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tph2Q8CGV2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tph2Q8CGV2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tph2Q8CGV2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tph2Q8CGV2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tph2Q8CGV2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tph2Q8CGV2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tph2Q8CGV2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tph2Q8CGV2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tph2Q8CGV2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tph2Q8CGV2 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tph2Q8CGV2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tph2Q8CGV2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tph2Q8CGV2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tph2Q8CGV2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tph2Q8CGV2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tph2Q8CGV2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tph2Q8CGV2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tph2Q8CGV2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tph2Q8CGV2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tph2Q8CGV2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tph2Q8CGV2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tph2Q8CGV2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tph2Q8CGV2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tph2Q8CGV2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tph2Q8CGV2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tph2Q8CGV2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tph2Q8CGV2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tph2Q8CGV2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tph2Q8CGV2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tph2Q8CGV2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tph2Q8CGV2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tph2Q8CGV2 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tph2Q8CGV2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tph2Q8CGV2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tph2Q8CGV2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tph2Q8CGV2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tph2Q8CGV2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tph2Q8CGV2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tph2Q8CGV2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tph2Q8CGV2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tph2Q8CGV2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tph2Q8CGV2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tph2Q8CGV2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tph2Q8CGV2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tph2Q8CGV2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tph2Q8CGV2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tph2Q8CGV2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tph2Q8CGV2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tph2Q8CGV2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tph2Q8CGV2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tph2Q8CGV2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tph2Q8CGV2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tph2Q8CGV2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tph2Q8CGV2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tph2Q8CGV2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tph2Q8CGV2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tph2Q8CGV2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tph2Q8CGV2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tph2Q8CGV2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tph2Q8CGV2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tph2Q8CGV2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tph2Q8CGV2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tph2Q8CGV2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tph2Q8CGV2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tph2Q8CGV2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tph2Q8CGV2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tph2Q8CGV2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tph2Q8CGV2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tph2Q8CGV2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tph2Q8CGV2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tph2Q8CGV2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tph2Q8CGV2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tph2Q8CGV2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tph2Q8CGV2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tph2Q8CGV2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tph2Q8CGV2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tph2Q8CGV2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms