Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFT2

Setd1b, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd1bQ8CFT2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Setd1bQ8CFT2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Setd1bQ8CFT2 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Setd1bQ8CFT2 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Setd1bQ8CFT2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Setd1bQ8CFT2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Setd1bQ8CFT2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Setd1bQ8CFT2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Setd1bQ8CFT2 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Setd1bQ8CFT2 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Setd1bQ8CFT2 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Setd1bQ8CFT2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Setd1bQ8CFT2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Setd1bQ8CFT2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Setd1bQ8CFT2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Setd1bQ8CFT2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Setd1bQ8CFT2 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Setd1bQ8CFT2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Setd1bQ8CFT2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Setd1bQ8CFT2 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
Setd1bQ8CFT2 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Setd1bQ8CFT2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Setd1bQ8CFT2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Setd1bQ8CFT2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Setd1bQ8CFT2 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Setd1bQ8CFT2 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Setd1bQ8CFT2 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Setd1bQ8CFT2 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Setd1bQ8CFT2 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Setd1bQ8CFT2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Setd1bQ8CFT2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Setd1bQ8CFT2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Setd1bQ8CFT2 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Setd1bQ8CFT2 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Setd1bQ8CFT2 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Setd1bQ8CFT2 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Setd1bQ8CFT2 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Setd1bQ8CFT2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Setd1bQ8CFT2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Setd1bQ8CFT2 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Setd1bQ8CFT2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Setd1bQ8CFT2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Setd1bQ8CFT2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Setd1bQ8CFT2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Setd1bQ8CFT2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Setd1bQ8CFT2 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Setd1bQ8CFT2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Setd1bQ8CFT2 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Setd1bQ8CFT2 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Setd1bQ8CFT2 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Setd1bQ8CFT2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Setd1bQ8CFT2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Setd1bQ8CFT2 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Setd1bQ8CFT2 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Setd1bQ8CFT2 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Setd1bQ8CFT2 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Setd1bQ8CFT2 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Setd1bQ8CFT2 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Setd1bQ8CFT2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Setd1bQ8CFT2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Setd1bQ8CFT2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Setd1bQ8CFT2 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Setd1bQ8CFT2 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Setd1bQ8CFT2 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Setd1bQ8CFT2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Setd1bQ8CFT2 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Setd1bQ8CFT2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Setd1bQ8CFT2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Setd1bQ8CFT2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Setd1bQ8CFT2 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Setd1bQ8CFT2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Setd1bQ8CFT2 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Setd1bQ8CFT2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Setd1bQ8CFT2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Setd1bQ8CFT2 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Setd1bQ8CFT2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Setd1bQ8CFT2 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Setd1bQ8CFT2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Setd1bQ8CFT2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Setd1bQ8CFT2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Setd1bQ8CFT2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Setd1bQ8CFT2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Setd1bQ8CFT2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Setd1bQ8CFT2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Setd1bQ8CFT2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Setd1bQ8CFT2 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Setd1bQ8CFT2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Setd1bQ8CFT2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Setd1bQ8CFT2 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Setd1bQ8CFT2 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Setd1bQ8CFT2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Setd1bQ8CFT2 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Setd1bQ8CFT2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Setd1bQ8CFT2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Setd1bQ8CFT2 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Setd1bQ8CFT2 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Setd1bQ8CFT2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Setd1bQ8CFT2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Setd1bQ8CFT2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Setd1bQ8CFT2 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms