Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hpf1Q8CFE2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
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Hpf1Q8CFE2 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms