Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdkl1Q8CEQ0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms