Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.6 ms