Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDR2

Rsph6a, Radial spoke head protein 6 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph6aQ8CDR2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rsph6aQ8CDR2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rsph6aQ8CDR2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rsph6aQ8CDR2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rsph6aQ8CDR2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rsph6aQ8CDR2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rsph6aQ8CDR2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rsph6aQ8CDR2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rsph6aQ8CDR2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rsph6aQ8CDR2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rsph6aQ8CDR2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rsph6aQ8CDR2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rsph6aQ8CDR2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rsph6aQ8CDR2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rsph6aQ8CDR2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rsph6aQ8CDR2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rsph6aQ8CDR2 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rsph6aQ8CDR2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rsph6aQ8CDR2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rsph6aQ8CDR2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rsph6aQ8CDR2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rsph6aQ8CDR2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rsph6aQ8CDR2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rsph6aQ8CDR2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rsph6aQ8CDR2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rsph6aQ8CDR2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rsph6aQ8CDR2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rsph6aQ8CDR2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Rsph6aQ8CDR2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rsph6aQ8CDR2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rsph6aQ8CDR2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rsph6aQ8CDR2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rsph6aQ8CDR2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rsph6aQ8CDR2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rsph6aQ8CDR2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rsph6aQ8CDR2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rsph6aQ8CDR2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rsph6aQ8CDR2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rsph6aQ8CDR2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Rsph6aQ8CDR2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rsph6aQ8CDR2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rsph6aQ8CDR2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rsph6aQ8CDR2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rsph6aQ8CDR2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rsph6aQ8CDR2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rsph6aQ8CDR2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rsph6aQ8CDR2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rsph6aQ8CDR2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rsph6aQ8CDR2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rsph6aQ8CDR2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rsph6aQ8CDR2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rsph6aQ8CDR2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rsph6aQ8CDR2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rsph6aQ8CDR2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rsph6aQ8CDR2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rsph6aQ8CDR2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Rsph6aQ8CDR2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rsph6aQ8CDR2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rsph6aQ8CDR2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Rsph6aQ8CDR2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rsph6aQ8CDR2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rsph6aQ8CDR2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rsph6aQ8CDR2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rsph6aQ8CDR2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rsph6aQ8CDR2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rsph6aQ8CDR2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rsph6aQ8CDR2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rsph6aQ8CDR2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rsph6aQ8CDR2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rsph6aQ8CDR2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rsph6aQ8CDR2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rsph6aQ8CDR2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rsph6aQ8CDR2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rsph6aQ8CDR2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rsph6aQ8CDR2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rsph6aQ8CDR2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rsph6aQ8CDR2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rsph6aQ8CDR2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rsph6aQ8CDR2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rsph6aQ8CDR2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rsph6aQ8CDR2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rsph6aQ8CDR2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rsph6aQ8CDR2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rsph6aQ8CDR2 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rsph6aQ8CDR2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rsph6aQ8CDR2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rsph6aQ8CDR2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rsph6aQ8CDR2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rsph6aQ8CDR2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rsph6aQ8CDR2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rsph6aQ8CDR2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rsph6aQ8CDR2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rsph6aQ8CDR2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rsph6aQ8CDR2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rsph6aQ8CDR2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rsph6aQ8CDR2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rsph6aQ8CDR2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rsph6aQ8CDR2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rsph6aQ8CDR2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rsph6aQ8CDR2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms