Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc87Q8CDL9 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc87Q8CDL9 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc87Q8CDL9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc87Q8CDL9 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc87Q8CDL9 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc87Q8CDL9 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc87Q8CDL9 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc87Q8CDL9 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc87Q8CDL9 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc87Q8CDL9 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc87Q8CDL9 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc87Q8CDL9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc87Q8CDL9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc87Q8CDL9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc87Q8CDL9 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc87Q8CDL9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc87Q8CDL9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc87Q8CDL9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc87Q8CDL9 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc87Q8CDL9 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc87Q8CDL9 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc87Q8CDL9 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc87Q8CDL9 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc87Q8CDL9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc87Q8CDL9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc87Q8CDL9 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc87Q8CDL9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc87Q8CDL9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc87Q8CDL9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc87Q8CDL9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc87Q8CDL9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc87Q8CDL9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc87Q8CDL9 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc87Q8CDL9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc87Q8CDL9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc87Q8CDL9 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc87Q8CDL9 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc87Q8CDL9 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc87Q8CDL9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc87Q8CDL9 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc87Q8CDL9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc87Q8CDL9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc87Q8CDL9 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc87Q8CDL9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc87Q8CDL9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc87Q8CDL9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc87Q8CDL9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc87Q8CDL9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc87Q8CDL9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc87Q8CDL9 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc87Q8CDL9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc87Q8CDL9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc87Q8CDL9 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc87Q8CDL9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc87Q8CDL9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc87Q8CDL9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc87Q8CDL9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc87Q8CDL9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc87Q8CDL9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc87Q8CDL9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc87Q8CDL9 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc87Q8CDL9 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc87Q8CDL9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc87Q8CDL9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc87Q8CDL9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc87Q8CDL9 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc87Q8CDL9 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc87Q8CDL9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc87Q8CDL9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc87Q8CDL9 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc87Q8CDL9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms