Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCK0

H2afy2, Core histone macro-H2A.2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afy2Q8CCK0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2afy2Q8CCK0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2afy2Q8CCK0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2afy2Q8CCK0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2afy2Q8CCK0 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2afy2Q8CCK0 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2afy2Q8CCK0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2afy2Q8CCK0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2afy2Q8CCK0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afy2Q8CCK0 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afy2Q8CCK0 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afy2Q8CCK0 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afy2Q8CCK0 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afy2Q8CCK0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afy2Q8CCK0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afy2Q8CCK0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afy2Q8CCK0 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afy2Q8CCK0 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afy2Q8CCK0 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afy2Q8CCK0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afy2Q8CCK0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afy2Q8CCK0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afy2Q8CCK0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afy2Q8CCK0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afy2Q8CCK0 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afy2Q8CCK0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afy2Q8CCK0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afy2Q8CCK0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afy2Q8CCK0 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afy2Q8CCK0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afy2Q8CCK0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afy2Q8CCK0 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afy2Q8CCK0 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afy2Q8CCK0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afy2Q8CCK0 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afy2Q8CCK0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afy2Q8CCK0 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afy2Q8CCK0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afy2Q8CCK0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afy2Q8CCK0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afy2Q8CCK0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afy2Q8CCK0 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afy2Q8CCK0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afy2Q8CCK0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afy2Q8CCK0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afy2Q8CCK0 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afy2Q8CCK0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afy2Q8CCK0 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afy2Q8CCK0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afy2Q8CCK0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afy2Q8CCK0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afy2Q8CCK0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afy2Q8CCK0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afy2Q8CCK0 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afy2Q8CCK0 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afy2Q8CCK0 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afy2Q8CCK0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afy2Q8CCK0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afy2Q8CCK0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afy2Q8CCK0 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afy2Q8CCK0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afy2Q8CCK0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afy2Q8CCK0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afy2Q8CCK0 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afy2Q8CCK0 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afy2Q8CCK0 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afy2Q8CCK0 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2afy2Q8CCK0 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2afy2Q8CCK0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2afy2Q8CCK0 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2afy2Q8CCK0 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2afy2Q8CCK0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2afy2Q8CCK0 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2afy2Q8CCK0 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2afy2Q8CCK0 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2afy2Q8CCK0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2afy2Q8CCK0 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2afy2Q8CCK0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2afy2Q8CCK0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2afy2Q8CCK0 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2afy2Q8CCK0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2afy2Q8CCK0 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2afy2Q8CCK0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2afy2Q8CCK0 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2afy2Q8CCK0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2afy2Q8CCK0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2afy2Q8CCK0 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2afy2Q8CCK0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2afy2Q8CCK0 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2afy2Q8CCK0 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2afy2Q8CCK0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2afy2Q8CCK0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2afy2Q8CCK0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2afy2Q8CCK0 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2afy2Q8CCK0 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2afy2Q8CCK0 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2afy2Q8CCK0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2afy2Q8CCK0 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2afy2Q8CCK0 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2afy2Q8CCK0 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms