Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC96

Uncharacterized protein C6orf222 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CC96 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q8CC96 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q8CC96 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q8CC96 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q8CC96 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q8CC96 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q8CC96 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q8CC96 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q8CC96 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q8CC96 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q8CC96 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q8CC96 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q8CC96 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q8CC96 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q8CC96 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q8CC96 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q8CC96 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q8CC96 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q8CC96 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q8CC96 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q8CC96 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Q8CC96 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Q8CC96 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q8CC96 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q8CC96 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q8CC96 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q8CC96 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q8CC96 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q8CC96 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q8CC96 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q8CC96 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q8CC96 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q8CC96 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q8CC96 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q8CC96 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q8CC96 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q8CC96 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q8CC96 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q8CC96 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q8CC96 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q8CC96 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q8CC96 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q8CC96 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q8CC96 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q8CC96 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Q8CC96 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q8CC96 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q8CC96 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Q8CC96 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q8CC96 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q8CC96 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q8CC96 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q8CC96 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q8CC96 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q8CC96 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q8CC96 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q8CC96 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q8CC96 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q8CC96 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q8CC96 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q8CC96 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q8CC96 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q8CC96 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q8CC96 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q8CC96 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q8CC96 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q8CC96 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q8CC96 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q8CC96 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q8CC96 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q8CC96 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q8CC96 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q8CC96 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q8CC96 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q8CC96 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q8CC96 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Q8CC96 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q8CC96 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q8CC96 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q8CC96 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q8CC96 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q8CC96 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q8CC96 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q8CC96 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q8CC96 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q8CC96 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q8CC96 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q8CC96 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q8CC96 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q8CC96 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q8CC96 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q8CC96 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q8CC96 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q8CC96 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q8CC96 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q8CC96 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q8CC96 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q8CC96 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q8CC96 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q8CC96 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms