Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC27

Cacnb2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb2Q8CC27 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cacnb2Q8CC27 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cacnb2Q8CC27 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cacnb2Q8CC27 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cacnb2Q8CC27 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cacnb2Q8CC27 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cacnb2Q8CC27 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cacnb2Q8CC27 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms