Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBD1

Nrip1, Nuclear receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip1Q8CBD1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nrip1Q8CBD1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nrip1Q8CBD1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Nrip1Q8CBD1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nrip1Q8CBD1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nrip1Q8CBD1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nrip1Q8CBD1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nrip1Q8CBD1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nrip1Q8CBD1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nrip1Q8CBD1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nrip1Q8CBD1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nrip1Q8CBD1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nrip1Q8CBD1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Nrip1Q8CBD1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nrip1Q8CBD1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nrip1Q8CBD1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Nrip1Q8CBD1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nrip1Q8CBD1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nrip1Q8CBD1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nrip1Q8CBD1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nrip1Q8CBD1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nrip1Q8CBD1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nrip1Q8CBD1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Nrip1Q8CBD1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nrip1Q8CBD1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nrip1Q8CBD1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nrip1Q8CBD1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nrip1Q8CBD1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nrip1Q8CBD1 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nrip1Q8CBD1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nrip1Q8CBD1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nrip1Q8CBD1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nrip1Q8CBD1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nrip1Q8CBD1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nrip1Q8CBD1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nrip1Q8CBD1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nrip1Q8CBD1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nrip1Q8CBD1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nrip1Q8CBD1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nrip1Q8CBD1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nrip1Q8CBD1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Nrip1Q8CBD1 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nrip1Q8CBD1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nrip1Q8CBD1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nrip1Q8CBD1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nrip1Q8CBD1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nrip1Q8CBD1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nrip1Q8CBD1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nrip1Q8CBD1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nrip1Q8CBD1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nrip1Q8CBD1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nrip1Q8CBD1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nrip1Q8CBD1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Nrip1Q8CBD1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nrip1Q8CBD1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nrip1Q8CBD1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Nrip1Q8CBD1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nrip1Q8CBD1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nrip1Q8CBD1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nrip1Q8CBD1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nrip1Q8CBD1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nrip1Q8CBD1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Nrip1Q8CBD1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nrip1Q8CBD1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nrip1Q8CBD1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nrip1Q8CBD1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nrip1Q8CBD1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nrip1Q8CBD1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nrip1Q8CBD1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nrip1Q8CBD1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nrip1Q8CBD1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Nrip1Q8CBD1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nrip1Q8CBD1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nrip1Q8CBD1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nrip1Q8CBD1 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Nrip1Q8CBD1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nrip1Q8CBD1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms