Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBC6

Lrrn3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn3Q8CBC6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrn3Q8CBC6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrn3Q8CBC6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms