Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9U4

Gm9958, MCG147145, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9958Q8C9U4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm9958Q8C9U4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm9958Q8C9U4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm9958Q8C9U4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm9958Q8C9U4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm9958Q8C9U4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm9958Q8C9U4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm9958Q8C9U4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm9958Q8C9U4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm9958Q8C9U4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm9958Q8C9U4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm9958Q8C9U4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm9958Q8C9U4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm9958Q8C9U4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm9958Q8C9U4 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm9958Q8C9U4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm9958Q8C9U4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm9958Q8C9U4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm9958Q8C9U4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm9958Q8C9U4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm9958Q8C9U4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm9958Q8C9U4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm9958Q8C9U4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm9958Q8C9U4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm9958Q8C9U4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm9958Q8C9U4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm9958Q8C9U4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm9958Q8C9U4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm9958Q8C9U4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm9958Q8C9U4 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm9958Q8C9U4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm9958Q8C9U4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm9958Q8C9U4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm9958Q8C9U4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm9958Q8C9U4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm9958Q8C9U4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm9958Q8C9U4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm9958Q8C9U4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm9958Q8C9U4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm9958Q8C9U4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm9958Q8C9U4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm9958Q8C9U4 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm9958Q8C9U4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm9958Q8C9U4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm9958Q8C9U4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm9958Q8C9U4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm9958Q8C9U4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm9958Q8C9U4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm9958Q8C9U4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm9958Q8C9U4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm9958Q8C9U4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm9958Q8C9U4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm9958Q8C9U4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm9958Q8C9U4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm9958Q8C9U4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm9958Q8C9U4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm9958Q8C9U4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm9958Q8C9U4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm9958Q8C9U4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm9958Q8C9U4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm9958Q8C9U4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm9958Q8C9U4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm9958Q8C9U4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm9958Q8C9U4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm9958Q8C9U4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm9958Q8C9U4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm9958Q8C9U4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm9958Q8C9U4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm9958Q8C9U4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm9958Q8C9U4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm9958Q8C9U4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm9958Q8C9U4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Gm9958Q8C9U4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm9958Q8C9U4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm9958Q8C9U4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm9958Q8C9U4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm9958Q8C9U4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm9958Q8C9U4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm9958Q8C9U4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm9958Q8C9U4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm9958Q8C9U4 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm9958Q8C9U4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm9958Q8C9U4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm9958Q8C9U4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm9958Q8C9U4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm9958Q8C9U4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm9958Q8C9U4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm9958Q8C9U4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm9958Q8C9U4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm9958Q8C9U4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm9958Q8C9U4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm9958Q8C9U4 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm9958Q8C9U4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm9958Q8C9U4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm9958Q8C9U4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm9958Q8C9U4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm9958Q8C9U4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm9958Q8C9U4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm9958Q8C9U4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm9958Q8C9U4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms