Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9J3

Spef2, Sperm flagellar protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef2Q8C9J3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Spef2Q8C9J3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Spef2Q8C9J3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Spef2Q8C9J3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Spef2Q8C9J3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Spef2Q8C9J3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Spef2Q8C9J3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Spef2Q8C9J3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Spef2Q8C9J3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Spef2Q8C9J3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Spef2Q8C9J3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Spef2Q8C9J3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Spef2Q8C9J3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Spef2Q8C9J3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Spef2Q8C9J3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Spef2Q8C9J3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Spef2Q8C9J3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Spef2Q8C9J3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Spef2Q8C9J3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Spef2Q8C9J3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Spef2Q8C9J3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Spef2Q8C9J3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Spef2Q8C9J3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Spef2Q8C9J3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Spef2Q8C9J3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Spef2Q8C9J3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Spef2Q8C9J3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Spef2Q8C9J3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Spef2Q8C9J3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Spef2Q8C9J3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Spef2Q8C9J3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Spef2Q8C9J3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Spef2Q8C9J3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Spef2Q8C9J3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Spef2Q8C9J3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Spef2Q8C9J3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Spef2Q8C9J3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Spef2Q8C9J3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Spef2Q8C9J3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Spef2Q8C9J3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Spef2Q8C9J3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Spef2Q8C9J3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Spef2Q8C9J3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Spef2Q8C9J3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Spef2Q8C9J3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Spef2Q8C9J3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Spef2Q8C9J3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Spef2Q8C9J3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Spef2Q8C9J3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Spef2Q8C9J3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Spef2Q8C9J3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Spef2Q8C9J3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Spef2Q8C9J3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Spef2Q8C9J3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Spef2Q8C9J3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Spef2Q8C9J3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Spef2Q8C9J3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Spef2Q8C9J3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Spef2Q8C9J3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Spef2Q8C9J3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Spef2Q8C9J3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Spef2Q8C9J3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Spef2Q8C9J3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Spef2Q8C9J3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Spef2Q8C9J3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Spef2Q8C9J3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Spef2Q8C9J3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Spef2Q8C9J3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Spef2Q8C9J3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Spef2Q8C9J3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Spef2Q8C9J3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Spef2Q8C9J3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Spef2Q8C9J3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Spef2Q8C9J3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Spef2Q8C9J3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Spef2Q8C9J3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Spef2Q8C9J3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Spef2Q8C9J3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Spef2Q8C9J3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Spef2Q8C9J3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Spef2Q8C9J3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Spef2Q8C9J3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Spef2Q8C9J3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Spef2Q8C9J3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Spef2Q8C9J3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Spef2Q8C9J3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Spef2Q8C9J3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Spef2Q8C9J3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Spef2Q8C9J3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Spef2Q8C9J3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Spef2Q8C9J3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Spef2Q8C9J3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Spef2Q8C9J3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Spef2Q8C9J3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Spef2Q8C9J3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Spef2Q8C9J3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Spef2Q8C9J3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Spef2Q8C9J3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Spef2Q8C9J3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Spef2Q8C9J3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms