Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FarsaQ8C0C7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
FarsaQ8C0C7 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
FarsaQ8C0C7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FarsaQ8C0C7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FarsaQ8C0C7 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FarsaQ8C0C7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FarsaQ8C0C7 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FarsaQ8C0C7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FarsaQ8C0C7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FarsaQ8C0C7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FarsaQ8C0C7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FarsaQ8C0C7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FarsaQ8C0C7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FarsaQ8C0C7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FarsaQ8C0C7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FarsaQ8C0C7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FarsaQ8C0C7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FarsaQ8C0C7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FarsaQ8C0C7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FarsaQ8C0C7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FarsaQ8C0C7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FarsaQ8C0C7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FarsaQ8C0C7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FarsaQ8C0C7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FarsaQ8C0C7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FarsaQ8C0C7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FarsaQ8C0C7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FarsaQ8C0C7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FarsaQ8C0C7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FarsaQ8C0C7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FarsaQ8C0C7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FarsaQ8C0C7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FarsaQ8C0C7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FarsaQ8C0C7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FarsaQ8C0C7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FarsaQ8C0C7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FarsaQ8C0C7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
FarsaQ8C0C7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FarsaQ8C0C7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FarsaQ8C0C7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FarsaQ8C0C7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FarsaQ8C0C7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FarsaQ8C0C7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FarsaQ8C0C7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FarsaQ8C0C7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FarsaQ8C0C7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FarsaQ8C0C7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms