Protein–RNA interactions for Protein: Q8BZW8

Nhlrc2, NHL repeat-containing protein 2, mousemouse

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Length 725 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc2Q8BZW8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Nhlrc2Q8BZW8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nhlrc2Q8BZW8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nhlrc2Q8BZW8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
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Nhlrc2Q8BZW8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
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Nhlrc2Q8BZW8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Nhlrc2Q8BZW8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nhlrc2Q8BZW8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Nhlrc2Q8BZW8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nhlrc2Q8BZW8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nhlrc2Q8BZW8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nhlrc2Q8BZW8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nhlrc2Q8BZW8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Nhlrc2Q8BZW8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nhlrc2Q8BZW8 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nhlrc2Q8BZW8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nhlrc2Q8BZW8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nhlrc2Q8BZW8 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nhlrc2Q8BZW8 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nhlrc2Q8BZW8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nhlrc2Q8BZW8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nhlrc2Q8BZW8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nhlrc2Q8BZW8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nhlrc2Q8BZW8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nhlrc2Q8BZW8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nhlrc2Q8BZW8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nhlrc2Q8BZW8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nhlrc2Q8BZW8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Nhlrc2Q8BZW8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nhlrc2Q8BZW8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nhlrc2Q8BZW8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nhlrc2Q8BZW8 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms