Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX70

Vps13c, Vacuolar protein sorting-associated protein 13C, mousemouse

Predictions only

Length 3,748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps13cQ8BX70 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps13cQ8BX70 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps13cQ8BX70 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps13cQ8BX70 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps13cQ8BX70 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps13cQ8BX70 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps13cQ8BX70 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps13cQ8BX70 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps13cQ8BX70 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps13cQ8BX70 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps13cQ8BX70 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps13cQ8BX70 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps13cQ8BX70 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps13cQ8BX70 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps13cQ8BX70 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps13cQ8BX70 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps13cQ8BX70 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps13cQ8BX70 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps13cQ8BX70 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps13cQ8BX70 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps13cQ8BX70 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps13cQ8BX70 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps13cQ8BX70 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps13cQ8BX70 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps13cQ8BX70 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps13cQ8BX70 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps13cQ8BX70 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps13cQ8BX70 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps13cQ8BX70 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps13cQ8BX70 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps13cQ8BX70 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps13cQ8BX70 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps13cQ8BX70 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps13cQ8BX70 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps13cQ8BX70 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps13cQ8BX70 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps13cQ8BX70 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps13cQ8BX70 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps13cQ8BX70 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps13cQ8BX70 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps13cQ8BX70 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps13cQ8BX70 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps13cQ8BX70 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps13cQ8BX70 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps13cQ8BX70 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps13cQ8BX70 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps13cQ8BX70 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps13cQ8BX70 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps13cQ8BX70 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps13cQ8BX70 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps13cQ8BX70 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps13cQ8BX70 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps13cQ8BX70 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps13cQ8BX70 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps13cQ8BX70 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps13cQ8BX70 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps13cQ8BX70 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps13cQ8BX70 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps13cQ8BX70 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps13cQ8BX70 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps13cQ8BX70 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps13cQ8BX70 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps13cQ8BX70 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps13cQ8BX70 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps13cQ8BX70 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps13cQ8BX70 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps13cQ8BX70 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps13cQ8BX70 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps13cQ8BX70 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps13cQ8BX70 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps13cQ8BX70 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps13cQ8BX70 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vps13cQ8BX70 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vps13cQ8BX70 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Vps13cQ8BX70 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vps13cQ8BX70 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vps13cQ8BX70 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vps13cQ8BX70 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vps13cQ8BX70 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vps13cQ8BX70 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vps13cQ8BX70 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vps13cQ8BX70 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps13cQ8BX70 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps13cQ8BX70 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps13cQ8BX70 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps13cQ8BX70 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps13cQ8BX70 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps13cQ8BX70 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps13cQ8BX70 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps13cQ8BX70 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps13cQ8BX70 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps13cQ8BX70 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps13cQ8BX70 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps13cQ8BX70 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps13cQ8BX70 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps13cQ8BX70 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps13cQ8BX70 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps13cQ8BX70 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps13cQ8BX70 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps13cQ8BX70 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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