Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ctdsp2Q8BX07 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdsp2Q8BX07 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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