Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUJ9

Lrp12, Low-density lipoprotein receptor-related protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp12Q8BUJ9 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrp12Q8BUJ9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrp12Q8BUJ9 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrp12Q8BUJ9 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrp12Q8BUJ9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrp12Q8BUJ9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrp12Q8BUJ9 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrp12Q8BUJ9 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrp12Q8BUJ9 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrp12Q8BUJ9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrp12Q8BUJ9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrp12Q8BUJ9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrp12Q8BUJ9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrp12Q8BUJ9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrp12Q8BUJ9 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrp12Q8BUJ9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrp12Q8BUJ9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrp12Q8BUJ9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrp12Q8BUJ9 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrp12Q8BUJ9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrp12Q8BUJ9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrp12Q8BUJ9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrp12Q8BUJ9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrp12Q8BUJ9 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrp12Q8BUJ9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrp12Q8BUJ9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrp12Q8BUJ9 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrp12Q8BUJ9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrp12Q8BUJ9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrp12Q8BUJ9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrp12Q8BUJ9 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrp12Q8BUJ9 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrp12Q8BUJ9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrp12Q8BUJ9 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrp12Q8BUJ9 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrp12Q8BUJ9 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrp12Q8BUJ9 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrp12Q8BUJ9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrp12Q8BUJ9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrp12Q8BUJ9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrp12Q8BUJ9 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrp12Q8BUJ9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrp12Q8BUJ9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrp12Q8BUJ9 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrp12Q8BUJ9 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrp12Q8BUJ9 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrp12Q8BUJ9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrp12Q8BUJ9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrp12Q8BUJ9 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrp12Q8BUJ9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrp12Q8BUJ9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrp12Q8BUJ9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrp12Q8BUJ9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrp12Q8BUJ9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrp12Q8BUJ9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrp12Q8BUJ9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrp12Q8BUJ9 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrp12Q8BUJ9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrp12Q8BUJ9 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrp12Q8BUJ9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lrp12Q8BUJ9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrp12Q8BUJ9 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrp12Q8BUJ9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrp12Q8BUJ9 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrp12Q8BUJ9 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrp12Q8BUJ9 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrp12Q8BUJ9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrp12Q8BUJ9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrp12Q8BUJ9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrp12Q8BUJ9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrp12Q8BUJ9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrp12Q8BUJ9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrp12Q8BUJ9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrp12Q8BUJ9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrp12Q8BUJ9 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrp12Q8BUJ9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrp12Q8BUJ9 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrp12Q8BUJ9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrp12Q8BUJ9 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrp12Q8BUJ9 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrp12Q8BUJ9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrp12Q8BUJ9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrp12Q8BUJ9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrp12Q8BUJ9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrp12Q8BUJ9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrp12Q8BUJ9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrp12Q8BUJ9 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrp12Q8BUJ9 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrp12Q8BUJ9 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrp12Q8BUJ9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrp12Q8BUJ9 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrp12Q8BUJ9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrp12Q8BUJ9 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrp12Q8BUJ9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrp12Q8BUJ9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrp12Q8BUJ9 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrp12Q8BUJ9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrp12Q8BUJ9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrp12Q8BUJ9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrp12Q8BUJ9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms