Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLH7

Hirip3, HIRA-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hirip3Q8BLH7 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hirip3Q8BLH7 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Hirip3Q8BLH7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hirip3Q8BLH7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hirip3Q8BLH7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hirip3Q8BLH7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hirip3Q8BLH7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hirip3Q8BLH7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hirip3Q8BLH7 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hirip3Q8BLH7 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hirip3Q8BLH7 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hirip3Q8BLH7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Hirip3Q8BLH7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Hirip3Q8BLH7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Hirip3Q8BLH7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Hirip3Q8BLH7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms