Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp54Q8BL06 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp54Q8BL06 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp54Q8BL06 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp54Q8BL06 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp54Q8BL06 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp54Q8BL06 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp54Q8BL06 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp54Q8BL06 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp54Q8BL06 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp54Q8BL06 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp54Q8BL06 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp54Q8BL06 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp54Q8BL06 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp54Q8BL06 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp54Q8BL06 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp54Q8BL06 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp54Q8BL06 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp54Q8BL06 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp54Q8BL06 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp54Q8BL06 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp54Q8BL06 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp54Q8BL06 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp54Q8BL06 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp54Q8BL06 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp54Q8BL06 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp54Q8BL06 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp54Q8BL06 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp54Q8BL06 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp54Q8BL06 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp54Q8BL06 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp54Q8BL06 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp54Q8BL06 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp54Q8BL06 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp54Q8BL06 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp54Q8BL06 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp54Q8BL06 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp54Q8BL06 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp54Q8BL06 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp54Q8BL06 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp54Q8BL06 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Usp54Q8BL06 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usp54Q8BL06 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usp54Q8BL06 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usp54Q8BL06 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Usp54Q8BL06 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp54Q8BL06 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp54Q8BL06 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp54Q8BL06 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp54Q8BL06 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp54Q8BL06 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp54Q8BL06 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp54Q8BL06 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp54Q8BL06 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp54Q8BL06 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp54Q8BL06 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp54Q8BL06 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp54Q8BL06 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp54Q8BL06 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp54Q8BL06 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp54Q8BL06 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp54Q8BL06 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp54Q8BL06 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp54Q8BL06 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp54Q8BL06 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp54Q8BL06 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp54Q8BL06 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp54Q8BL06 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp54Q8BL06 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp54Q8BL06 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp54Q8BL06 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp54Q8BL06 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp54Q8BL06 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp54Q8BL06 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp54Q8BL06 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp54Q8BL06 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp54Q8BL06 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp54Q8BL06 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp54Q8BL06 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp54Q8BL06 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp54Q8BL06 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp54Q8BL06 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp54Q8BL06 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp54Q8BL06 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp54Q8BL06 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp54Q8BL06 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp54Q8BL06 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp54Q8BL06 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp54Q8BL06 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp54Q8BL06 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp54Q8BL06 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp54Q8BL06 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp54Q8BL06 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp54Q8BL06 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp54Q8BL06 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp54Q8BL06 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp54Q8BL06 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp54Q8BL06 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp54Q8BL06 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp54Q8BL06 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms