Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdca8Q8BHX3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdca8Q8BHX3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdca8Q8BHX3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdca8Q8BHX3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdca8Q8BHX3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdca8Q8BHX3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdca8Q8BHX3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdca8Q8BHX3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdca8Q8BHX3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdca8Q8BHX3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdca8Q8BHX3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdca8Q8BHX3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdca8Q8BHX3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdca8Q8BHX3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdca8Q8BHX3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdca8Q8BHX3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdca8Q8BHX3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdca8Q8BHX3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdca8Q8BHX3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdca8Q8BHX3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdca8Q8BHX3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdca8Q8BHX3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdca8Q8BHX3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdca8Q8BHX3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdca8Q8BHX3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdca8Q8BHX3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdca8Q8BHX3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdca8Q8BHX3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdca8Q8BHX3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdca8Q8BHX3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdca8Q8BHX3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms