Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGY9

Slc5a7, High affinity choline transporter 1, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a7Q8BGY9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc5a7Q8BGY9 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc5a7Q8BGY9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc5a7Q8BGY9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc5a7Q8BGY9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Slc5a7Q8BGY9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
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Slc5a7Q8BGY9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc5a7Q8BGY9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc5a7Q8BGY9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Slc5a7Q8BGY9 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Slc5a7Q8BGY9 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc5a7Q8BGY9 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc5a7Q8BGY9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc5a7Q8BGY9 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc5a7Q8BGY9 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc5a7Q8BGY9 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc5a7Q8BGY9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc5a7Q8BGY9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Slc5a7Q8BGY9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Slc5a7Q8BGY9 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc5a7Q8BGY9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc5a7Q8BGY9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc5a7Q8BGY9 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc5a7Q8BGY9 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc5a7Q8BGY9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc5a7Q8BGY9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc5a7Q8BGY9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc5a7Q8BGY9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc5a7Q8BGY9 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc5a7Q8BGY9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc5a7Q8BGY9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc5a7Q8BGY9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc5a7Q8BGY9 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc5a7Q8BGY9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc5a7Q8BGY9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc5a7Q8BGY9 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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