Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGX3

Lrtm2, Leucine-rich repeat and transmembrane domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrtm2Q8BGX3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrtm2Q8BGX3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms