Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGX2

Timm29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm29Q8BGX2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Timm29Q8BGX2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Timm29Q8BGX2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Timm29Q8BGX2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Timm29Q8BGX2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Timm29Q8BGX2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Timm29Q8BGX2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Timm29Q8BGX2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Timm29Q8BGX2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Timm29Q8BGX2 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Timm29Q8BGX2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Timm29Q8BGX2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Timm29Q8BGX2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Timm29Q8BGX2 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Timm29Q8BGX2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Timm29Q8BGX2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Timm29Q8BGX2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Timm29Q8BGX2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Timm29Q8BGX2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Timm29Q8BGX2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Timm29Q8BGX2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Timm29Q8BGX2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Timm29Q8BGX2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Timm29Q8BGX2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Timm29Q8BGX2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Timm29Q8BGX2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Timm29Q8BGX2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Timm29Q8BGX2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Timm29Q8BGX2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Timm29Q8BGX2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Timm29Q8BGX2 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Timm29Q8BGX2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Timm29Q8BGX2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Timm29Q8BGX2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Timm29Q8BGX2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Timm29Q8BGX2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Timm29Q8BGX2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Timm29Q8BGX2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Timm29Q8BGX2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Timm29Q8BGX2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Timm29Q8BGX2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Timm29Q8BGX2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Timm29Q8BGX2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Timm29Q8BGX2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Timm29Q8BGX2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Timm29Q8BGX2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Timm29Q8BGX2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Timm29Q8BGX2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Timm29Q8BGX2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Timm29Q8BGX2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Timm29Q8BGX2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Timm29Q8BGX2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Timm29Q8BGX2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Timm29Q8BGX2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Timm29Q8BGX2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Timm29Q8BGX2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Timm29Q8BGX2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Timm29Q8BGX2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Timm29Q8BGX2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Timm29Q8BGX2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Timm29Q8BGX2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Timm29Q8BGX2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Timm29Q8BGX2 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Timm29Q8BGX2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Timm29Q8BGX2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Timm29Q8BGX2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Timm29Q8BGX2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Timm29Q8BGX2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Timm29Q8BGX2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Timm29Q8BGX2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Timm29Q8BGX2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Timm29Q8BGX2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Timm29Q8BGX2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Timm29Q8BGX2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Timm29Q8BGX2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Timm29Q8BGX2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Timm29Q8BGX2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Timm29Q8BGX2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Timm29Q8BGX2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Timm29Q8BGX2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Timm29Q8BGX2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Timm29Q8BGX2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Timm29Q8BGX2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Timm29Q8BGX2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Timm29Q8BGX2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Timm29Q8BGX2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Timm29Q8BGX2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Timm29Q8BGX2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Timm29Q8BGX2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Timm29Q8BGX2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Timm29Q8BGX2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Timm29Q8BGX2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Timm29Q8BGX2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Timm29Q8BGX2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Timm29Q8BGX2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Timm29Q8BGX2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Timm29Q8BGX2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Timm29Q8BGX2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Timm29Q8BGX2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Timm29Q8BGX2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms