Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Atg4dQ8BGV9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg4dQ8BGV9 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms