Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGM5

Best2, Bestrophin-2, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best2Q8BGM5 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Best2Q8BGM5 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms